Die Leukämie-Atlas: Forscher enthüllen Proteinen, signal-Krankheit: Computational Forscher entwickeln protein-atlas zu beschleunigen personalisierte Medizin

Nur etwa einer von vier Patienten mit akuter myeloischer Leukämie (AML) überleben fünf Jahre nach der ersten Diagnose. Zur Verbesserung der überlebensrate, Forscher an Der University of Texas at San Antonio (UTSA) und der University of Texas MD Anderson Cancer Center geschaffen, ein online-atlas zu identifizieren und zu klassifizieren protein vorhandenen Signaturen bei AML Diagnose.

Die neue protein-Klassifizierungen helfen, Forscher und Kliniker empfehlen eine bessere Behandlung und personalisierte Medizin für Patienten mit dieser aggressiven Krebs, der Auftritt, im Blut und Knochenmark. Die bahnbrechende Forschung veröffentlicht in der aktuellen April-Ausgabe von Natur Biomedical Engineering.

Forscher Amina Qutub, ein außerordentlicher professor in der UTSA Department of Biomedical Engineering (wechselte UTSA im Jahr 2018 von der Rice University), und Onkologen Steven M. Kornblau, professor und Praktizierender Arzt in der Abteilung der Leukämie bei UT MD Anderson Cancer Center, untersucht die genetischen, epigenetischen und ökologische Vielfalt, das Auftritt, in Krebszellen aufgrund der AML. Die Analyse von Proteom-Screening von 205 Patienten-Biopsien, die an MD Anderson Cancer Center, der Erstautor Chenyue Wendy Hu (damals ein student an der Qutub Lab, die nun an Uber Technologies), Kornblau und Qutb entwickelte eine neue rechnerische Methode namens MetaGalaxy zur Kategorisierung der protein-Signaturen in 154 verschiedenen mustern, basierend auf Ihrer zellulären Funktionen und Wege.

Durch die Annäherung an diese Herausforderung durch die einzigartige Linse zu entwickeln, die eine quantitative Zuordnung für jeden Leukämie-Patienten aus protein-expression im Blut und Knochenmark, eher als die standard-Linse der qualitativen Metriken und genetische Risiken allein, Qutub, Kornblau und Ihren wissenschaftlichen Mitarbeitern wird in der Lage sein, genauer zu kategorisieren, die Patienten in Risikogruppen und besser Vorhersagen können, Ihre Behandlungsergebnisse.

Um ein besseres Verständnis der AML Markenzeichen in der Proteomik (protein-system) Ebene und teilen die Ergebnisse Ihrer Arbeit mit anderen Forschern, die UTSA biomedizinische Technik-professor und Ihr team einschließlich der Hu und Studenten Andrew Ligeralde (jetzt an der University of California, Berkeley) und Allie Raybon (von der UTSA Department of Biomedical Engineering) baute ein web-portal, bekannt als Leukämie-Proteom-Atlas. Entworfen von Qutb und Kornblau-teams mit der Eingabe von klinischen Mitarbeitern weltweit, das online-portal bietet Onkologen und Krebs Wissenschaftler die Werkzeuge, die Sie brauchen, um zu untersuchen, AML protein-expressions-Muster von einem Patienten zum nächsten. Es bietet auch die Ermittler rund um die Welt mit leads für neue Leukämie-Forschung und neue computational tools.

Da viele genetische Mutationen können nicht anvisiert werden, die Proteom-profiling-und-Ziel-Identifikations-Prozess der in dieser Studie beschleunigt die Identifikation von therapeutischen targets. Außerdem treibt Forscher viel näher an die Entwicklung von individuelle Kombination von Therapien für Patienten, die auf Ihre einzigartige protein-Signaturen.

„Akute myeloische Leukämie stellt sich als Krebs so heterogen, dass es oft beschrieben wird als nicht nur eine, sondern eine Sammlung von Krankheiten,“ sagte Qutub. „Das zu entziffern, Spuren von Proteinen aus dem Blut und Knochenmark von Leukämie-Patienten, entwickelten wir eine neue computer-Analyse — MetaGalaxy — Identifizierung molekulare Mechanismen der Leukämie. Diese Kennzeichen sind Analog zu der Art und Weise Konstellationen guide navigation zu den Sternen: Sie bieten eine Karte an protein-änderungen, die für die Leukämie. Unser ‚Markenzeichen‘ Vorhersagen werden experimentell getestet durch Drogen-Bildschirme und werden ‚programmiert‘, die in Zellen durch synthetische manipulation von Proteinen. Ein Nächster Schritt, um diese Arbeit in die Klinik und auf die Patientenbetreuung auswirken, ist die Prüfung, ob diese Signaturen führen, um das aggressive Wachstum oder eine Resistenz gegen Chemotherapie beobachtet, die bei Leukämie-Patienten. Zur gleichen Zeit, zu beschleunigen, um die Forschung in Leukämie und Voraus der Jagd nach Behandlungen, wir liefern die Kennzeichen in einem online-Kompendium, wo Forscher und Onkologen weltweit bauen können, von den Ressourcen, Werkzeuge und Ergebnisse, LeukemiaAtlas.org.“