Roman genetische Signatur kann Vorhersagen, dass einige Arten von Brustkrebs identifiziert

Forscher konnten eine genetische Signatur, die mit prognostischer Wert für bestimmte Arten von Brustkrebs. Die Entdeckung trägt auch zu einem besseren Verständnis der molekularen Mechanismen bei der pathologischen Angiogenese, die aberrante proliferation der Gefäße, die Auftritt, während Krebs und andere Krankheiten.

Die Forschung, veröffentlicht in der Zeitschrift PLOS Genetics, kombiniert eine Studie von Genen, die bei Retinopathie als Modell der Angiogenese, mit der Analyse der transkriptomischen gen-Ausdruck-profile von öffentliche Brustkrebs-Datenbanken.

Geleitet von den Forschern an der Universität von São Paulo Institut für Chemie (IQ-USP) in Zusammenarbeit mit dem Ontario Institute for Cancer Research (OICR) in Toronto, Kanada, die Studie wurde unterstützt von São Paulo Research Foundation—FAPESP.

„Wir identifizierten eine Reihe von Genen, deren expression in Brustkrebs korreliert mit dem Grad der pathologischen Angiogenese im tumor, so dass es dient als eine genetische Signatur von Angiogenese, die prognostische und robuster als die Signaturen, die Sie zuvor ermittelt haben, angesichts der gefundenen Korrelation zwischen der Angiogenese und Tumoren im Allgemeinen,“ sagte Ricardo Giordano, professor an der IQ-USP, Leiter der Vaskulären Biologie-Labor und ein co-Autor der Studie.

In der Studie, die Brasilianische Wissenschaftler identifizierten 153 die veränderten Gene in gesunden und Kranken Netzhaut bei Mäusen. Aus dieser Liste, die Sie identifiziert 149 gleichwertige menschliche Gene. Das Ergebnis diente als Grundlage für eine genetische Signatur, die Studie in Partnerschaft mit dem Kanadischen team, mit einer Datenbank mit Informationen über Brustkrebs-Patientinnen. Die Schlussfolgerung war, dass die 11 wichtigsten Gene, die in die pathologische Angiogenese, die am besten abgeschnitten in Bezug auf die prognostische Güte.

Die pathologische Angiogenese ist Häufig zu Brustkrebs und Retinopathie. „Die Tatsache, dass diese beiden Krankheiten teilen dieses Prozesses, und die Angiogenese ist von grundlegender Bedeutung für die Entwicklung von Krebs im Allgemeinen führte uns zu versuchen eine Brücke zu bauen zwischen Retinopathie und Brustkrebs“, sagte João Carlos Setubal, Leiter der USP ‚ s Bioinformatik-Labor und auch ein co-Autor des Artikels.

Nach Angaben der Forscher, die Studie konzentriert sich auf Brustkrebs, da eine große Menge der verfügbaren Daten über die Krankheit. „Wir hatten Zugang zu einer riesigen Menge von öffentlichen Daten, angesichts der beträchtlichen Unterschiede zwischen einem Patienten und anderen. Dies ist der Fall für Brustkrebs. Genetische profile sind erhältlich für rund 2.000 Patienten,“ Setubal sagte.

Bioinformatik entscheidend war zu finden, die genetische Signatur, fügte er hinzu. Die generierten Daten in das Labor eingereicht wird, anspruchsvolle rechnerische Verarbeitung in Partnerschaft mit Forschern an der OICR in Kanada. Ein weiterer co-Autor der Studie, Rodrigo Guarischi de Sousa, dann ein Ph. D.-student, schrieb das Programm, das getestet die 149 menschlichen Gene, die als mögliche Komponenten der Unterschrift für Brustkrebs. In diesem Teil der Studie wurde er unterstützt durch ein Stipendium FAPESP für ein forschungspraktikum im Ausland betreut von Paul C. Boutros bei OICR.

Boutros ist derzeit ein Forscher in der Humangenetik Abteilung an der University of California, Los Angeles (UCLA). Guarischi de Sousa arbeitet jetzt bei der DASA, Brasiliens größte medizinische Diagnostik-Unternehmens.

Die Forscher planen, so suchen Sie nach Anwendungen für diese Signatur, insbesondere in der Behandlung für Brustkrebs. „Unser Nächstes Ziel ist es, weiter zu studieren, die Angiogenese in Krebs,“ Giordano sagte. „Wir sind daran interessiert bei der Identifizierung von Genen, die auf dieser Liste, die Ziele für die Entwicklung neuer Medikamente oder neue Anwendungen für bestehende Medikamente.“

Von Retinopathie zu Brustkrebs

Die Entdeckung der prognostische gen-Signatur für Brustkrebs ist das Ergebnis einer langen Studie, unterstützt durch ein Forschungsstipendium von den Nationalen Rat für Wissenschaftliche und Technologische Entwicklung (CNPq) ab 2010, wenn Giordano begann das Transkriptom (RNA-expression) und Proteom (protein-expression) von pathologischen retinalen Angiogenese.

„Als Ergebnis dieser Studie, unser Labor realisiert ein Maus-Modell zu Forschungs-Retinopathie. Die murinen Modell ist wichtig, da es schwierig ist, zu studieren Bildung von Blutgefäßen außerhalb des lebenden Gewebes. Dieses Modell ermöglicht es uns, zu induzieren Retinopathie durch die Modulation Sauerstoff-Niveaus und Untersuchung der Angiogenese im Labor“, Giordano sagte.

Die Forscher nahmen Blutproben von Mäusen zu untersuchen, die Unterschiede zwischen physiologischen Angiogenese, die Auftritt, bei gesunden Personen (in der Wundheilung, ovulation und Plazenta-Wachstum, zum Beispiel) und pathologischen Angiogenese, das ist Teil der Krankheit (z.B. Krebs oder arthritis).

„Wir beobachten, welche Gene exprimiert durch Endothelzellen [der inneren Auskleidung der Blutgefäße] bei beiden Arten der Angiogenese, immer auf der Suche nach den Genen, die mehr waren, ausgedrückt in einer Art, als die anderen,“ Giordano sagte.

Ein zentrales element des Experiments war Sauerstoff in der variation der Kammern mit Neugeborenen Maus Welpen. In den Kammern mit Sauerstoff bei 75% der Mäuse wurde retinopathic, in der Erwägung, dass in der Luft (Sauerstoff bei 20 Prozent) der Netzhaut entwickelt sich normal.

Das Verhältnis zwischen Sauerstoff und Zellen hat in den Nachrichten in letzter Zeit. William Kaelin, Peter Ratcliffe und Gregg Semenza gewonnen 2019 Nobelpreis in Physiologie oder Medizin für die Entdeckung, wie Zellen Sinne und Anpassung an die Veränderung der Verfügbarkeit von Sauerstoff.

Gene expression-based prognostic Signatur

Es ist wichtig zu betonen, dass klinische Anwendungen der genetischen Signatur für die Angiogenese unterscheiden können von Anwendungen, die sich aus dem marker-gen BRCA1. Das BRCA1-gen-mutation wurde Welt-berühmt in 2013, wenn die US-Schauspieler Angelina Jolie unterzog sich eine präventive doppelte Brustamputation, nachdem Gentests gezeigt, dass Sie trug die mutation und damit lief eine 87-Prozent-Risiko, an Brustkrebs zu erkranken.