Neue diagnostische Methode findet aggressiven Tumoren

Forscher bei Karolinska Institutet in Schweden entwickelt haben, eine neue, billige Methode identifizieren können, dass sehr heterogene Tumoren, die in der Regel sehr aggressiv, und daher behandelt werden müssen, mehr aggressiv. Die Technik wird vorgestellt in der Fachzeitschrift „Nature Communications“.

Ein gemeinsames Merkmal von Krebszellen ist, die Veränderungen in der Anzahl der Kopien, in der jedes Chromosom oder gen ist im Genom—ein Phänomen, bekannt als die Nummer des Exemplars änderungen oder CNAs. Innerhalb der gleichen tumor, Zellen, die zu verschiedenen anatomischen Teile des Tumors kann tragen verschiedene CNAs. Tumoren mit viele CNAs sind in der Regel sehr aggressiv und neigen zu reform mehr oft, auch nach einer harten Behandlungen.

Nun, die Bienko-Crosetto Labor im Karolinska Institutet und der Wissenschaft für das Leben Laboratory (SciLifeLab) in Schweden entwickelt haben, eine neue genomische Methode, benannt CUTseq, die beurteilen können, die Menge und die Art von CNAs in vielen verschiedenen teilen der gleichen tumor, bei einer viel niedrigeren Kosten als die bestehenden Technologien.

„Ich erwarte, dass CUTseq finden Sie viele nützliche Anwendungen in der Krebsdiagnostik“, sagt Nicola Crosetto, senior researcher am Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, und einer der leitenden Autoren des Papiers. „Multi-region-tumor-Sequenzierung wird zunehmend in der Diagnostik festlegen, um zu ermitteln, Patienten mit sehr heterogenen Tumoren, die behandelt werden müssen, mehr aggressiv. Ich glaube, dass unsere Methode kann eine führende Rolle spielen hier.“

Funktioniert die Methode mit der DNA extrahiert aus mehreren Biopsien und auch aus sehr kleinen Portionen von dünnen Gewebeschnitten,—die Art der Stichprobe, die Pathologen Häufig verlassen, um eine Diagnose von Krebs unter dem Mikroskop.

Durch Markierung der DNA extrahiert aus mehreren Regionen, die von den gleichen tumor sample mit einzigartigen molekularen barcodes, ein umfassendes Bild über die Heterogenität von CNAs in einen tumor kann man mit einer einzigen Sequenzierung experiment.

Anwendungen von CUTseq sind nicht nur beschränkt auf die Diagnose Krebs, so die Forscher hinter der neuen Methode.